У меня такие пупырышки появлялись, когда растениям не хватало полива и питания. В прошлом году исправила ситуацию: стала регулярно поливать и подкармливать золой и комплексными удобрениями. Кабачки снова стали гладкими. Попробуйте скорректировать уход – возможно, дело в питании.