Главное отличие - запах. У мяты он ярко ментоловый и освежающий, а у мелиссы - лимонный. Внешне тоже есть различия: у мяты листья более тёмные, узкие и зубчатые, а у мелиссы светлее и шире, с более мягкими краями. Цветки у мяты чаще сиреневые или розоватые, у мелиссы белые или слегка желтоватые.