Здравствуйте, Андрей. Ваша проблема достаточно типична для небольших водоемов в летний период. Постараюсь объяснить причины и дать рекомендации.
Скорее всего, вы столкнулись с замором. В теплой воде растворимость кислорода значительно снижается, а при температуре выше 25 градусов его становится катастрофически мало для карповых. Кроме того, ваши подозрения насчет навоза оправданы: органические удобрения при попадании в воду вызывают бурный рост микроорганизмов, которые в процессе разложения поглощают остатки кислорода и выделяют токсичный аммиак.
Что я рекомендую сделать прямо сейчас:
Усильте аэрацию. Если нет специального компрессора, используйте обычный насос: направьте струю воды из шланга вверх, чтобы она падала в пруд с высоты, насыщаясь воздухом.
Сделайте подмену воды. Слейте около 20-30% старой воды и долейте свежую, но делайте это постепенно, чтобы не было резкого температурного скачка.
Создайте тень. Попробуйте притенить часть зеркала воды щитами или посадите нимфеи, чтобы вода меньше прогревалась солнцем.
Надеюсь, это поможет спасти оставшуюся рыбу.