Главное отличие - соцветия и листья. У клевера чаще всего округлые трёхлистники с характерным светлым треугольником на листе, а цветки собраны в шаровидные головки (белые, розовые, красные). У люцерны листья более вытянутые, с зубчиками по краям, соцветие вытянутое, кистевидное, цветы фиолетово-синие.